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新的诊断方法可发现侵袭性肿瘤

瑞典Karolinska研究所的研究人员开发了一种廉价的新方法,该方法可识别高度异质性肿瘤,这些肿瘤往往具有很强的侵袭性,因此需要更积极地治疗。这项技术发表在科学杂志《自然通讯》上。

癌细胞的一个共同特征是基因组中每个染色体或基因存在的拷贝数改变-这种现象称为拷贝数改变或CNA。在同一肿瘤内,属于肿瘤不同解剖部位的细胞可能携带不同的CNA。带有许多CNA的肿瘤通常具有很强的侵袭性,并且即使经过严格的治疗,也往往会更频繁地进行重组。

现在,瑞典Karolinska研究所的Bienko-Crosetto实验室和瑞典生命科学实验室(SciLifeLab)开发了一种名为CUTseq的新基因组方法,该方法可以在同一肿瘤的许多不同部位评估CNA的数量和类型。成本远低于现有技术。

“我希望CUTseq在癌症诊断中会找到许多有用的应用,”卡罗林斯卡研究所医学生物化学与生物物理系高级研究员,论文的资深作者之一尼古拉·克罗塞托(Nicola Crosetto)说。“多区域肿瘤测序将越来越多地用于诊断环境,以鉴定需要高度积极治疗的高度异质性肿瘤患者。我相信我们的方法可以在这里发挥主导作用。”

该方法适用于从多个活组织检查甚至是薄薄的组织切片的极小部分中提取的DNA,病理学家通常依靠这种类型的样品在显微镜下进行癌症诊断。

通过用独特的分子条形码标记从同一肿瘤样品的多个区域提取的DNA,可以通过一次测序实验获得肿瘤中CNA异质性的全面图像。

据新方法背后的研究人员称,CUTseq的应用不仅限于癌症诊断。

“例如,CUTseq可以用作细胞系鉴定的平台,并监视大型细胞系储存库和生物库中的基因组稳定性,”该部门的高级研究员Magda Bienko说。“它还可以用于生态学,作为其他减少代表性的基因组测序方法(如RAD-seq)的替代方法,以经济高效的方式评估生物多样性。”

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